Basierend auf dem klassischen Roman „20.000 Meilen unter dem Meer“, von Jules Verne, erzählt die Serie „Nautilus“ die Vorgeschichte von Kapitän Nemo (Shazad Latif) und seinem legendären U-Boot Nautilus. Im Zentrum stehen ein indischer Prinz, der seines Geburtsrechts und seiner Familie beraubt wurde, ein Gefangener der East India Company und ein Mann, der auf Rache aus war, weil man ihm alles genommen hatte. Kapitän Nemo sticht mit seiner bunt zusammengewürfelten Crew an Bord des beeindruckenden Schiffes in See, kämpft gegen Feinde und entdeckt magische Unterwasserwelten.